A mediados del siglo XIX los médicos mexicanos llevaron a cabo estudios histológicos microscópicos de diversos tumores. Con base en dichos análisis produjeron una discusión en la que algunos de ellos muestran ciertas reservas acerca de la utilidad práctica y epistemológica del estudio histológico para el ejercicio de la clínica. En contraste abogan por el diagnóstico y tratamiento temprano de las tumoraciones. Es hasta la última década del siglo, cuando hubo madurado la histología, que algunos médicos hacen una apología del uso del microscopio y la histología para el estudio de piezas anatómicas y el diagnóstico de los tumores. En el presente trabajo propongo que quienes defendieron esta vertiente de la anatomía patológica emplearon este discurso a manera de justificación para fundar un espacio que les permitiera llevar a cabo sus estudios, esto permitió, a su vez, la institucionalización de la práctica histológica y el uso del microscopio, a pesar de que el uso del instrumento en el estudio de los tejidos, en principio no pareció aportar conocimientos nuevos a la ciencia y a la práctica médica cotidiana. Me interesa subrayar que la progresiva institucionalización de la histología microscópica se debió en gran medida a un contexto complejo que involucra discusiones médicas sobre prácticas, conocimientos, instrumentos e intereses grupales.